Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms