Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF9Q3BBW0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF9Q3BBW0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms