Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms