Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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