Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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