Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTBP1Q13363 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms