Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACACAQ13085 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACACAQ13085 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms