Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIRE1Q08AE8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms