Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YOR392WYOR392W 444 nt3.73□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 snR35snR35 204 nt3.73□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 REB1YBR049C 2433 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 FMP10YER182W 735 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RPL11BYGR085C 525 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RTS3YGR161C 792 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 HIT1YJR055W 495 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 BET3YKR068C 582 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YBR051WYBR051W 351 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RPL11AYPR102C 525 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 CDC40YDR364C 1368 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 EBS1YDR206W 2655 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 JIP5YPR169W 1479 nt3.72□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 MCD4YKL165C 2760 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 AHC2YCR082W 387 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 RPL27BYDR471W 411 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YEL075CYEL075C 369 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YHR212CYHR212C 336 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YIL141WYIL141W 390 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YJL086CYJL086C 369 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YJR111CYJR111C 852 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YAR060CYAR060C 336 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 PDP3YLR455W 915 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 COQ5YML110C 924 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 RIO2YNL207W 1278 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 MPD2YOL088C 834 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YPR096CYPR096C 303 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 FLO10YKR102W 3510 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 STI1YOR027W 1770 nt3.71□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 NAT1YDL040C 2565 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 GPI1YGR216C 1830 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 HTA1YDR225W 399 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 GPI19YDR437W 423 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 TWF1YGR080W 999 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 ECM4YKR076W 1113 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 PBA1YLR199C 831 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 RIM9YMR063W 720 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 VID24YBR105C 1089 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 SHS1YDL225W 1656 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 ALG8YOR067C 1734 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 ERG5YMR015C 1617 nt3.7□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 PMT6YGR199W 2280 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 ATG21YPL100W 1491 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 CDC50YCR094W 1176 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 MIC19YFR011C 513 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YOL114CYOL114C 609 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 PAM1YDR251W 2493 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YMR018WYMR018W 1545 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 NUP159YIL115C 4383 nt3.69□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 NUP85YJR042W 2235 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YRM1YOR172W 2361 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 OSH3YHR073W 2991 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 IRC3YDR332W 2070 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YDR537CYDR537C 606 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 BIG1YHR101C 1008 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YLR076CYLR076C 423 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YAR053WYAR053W 297 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 RPL13BYMR142C 600 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 RPS16AYMR143W 432 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 TIM12YBR091C 330 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 TGL3YMR313C 1929 nt3.68□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 SKP2YNL311C 2292 nt3.67□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YDR366CYDR366C 399 nt3.67□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 SPT2YER161C 1002 nt3.67□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 CRG1YHR209W 876 nt3.67□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YAL004WYAL004W 648 nt3.67□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt3.67□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 BEM4YPL161C 1902 nt3.67□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 APE2YKL157W 2859 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 HAA1YPR008W 2085 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 TRX3YCR083W 384 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 ARF1YDL192W 546 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 ERV1YGR029W 570 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 POG1YIL122W 1056 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YPL225WYPL225W 441 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 LTP1YPR073C 486 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 FRE4YNR060W 2160 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 MTR4YJL050W 3222 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 SPT10YJL127C 1923 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 SLA1YBL007C 3735 nt3.66□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YKL050CYKL050C 2769 nt3.65□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 POL4YCR014C 1749 nt3.65□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 CDC55YGL190C 1581 nt3.65□□□□□ -1.82
SGO1Q08490 YCR022CYCR022C 345 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 IRC2YDR112W 309 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YFR054CYFR054C 579 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SPT4YGR063C 309 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 MVB12YGR206W 306 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YHL026CYHL026C 948 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YKL066WYKL066W 444 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YPL197CYPL197C 414 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RRI2YOL117W 1938 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YJL132WYJL132W 2253 nt3.65□□□□□ -1.83
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