Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 VPS53YJL029C 2469 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 FAR1YJL157C 2493 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 ENA5YDR038C 3276 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YDL180WYDL180W 1644 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PET54YGR222W 882 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 TIM10YHR005C-A 282 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YLR224WYLR224W 1110 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 NTC20YBR188C 423 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 MPS1YDL028C 2295 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 IOC3YFR013W 2364 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 REC8YPR007C 2043 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 ARO1YDR127W 4767 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 DOA4YDR069C 2781 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 MUS81YDR386W 1899 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 FRE8YLR047C 2061 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 UTP15YMR093W 1542 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 FUN30YAL019W 3396 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 SHE4YOR035C 2370 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PHO81YGR233C 3537 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 VMA8YEL051W 771 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YJL086CYJL086C 369 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 BER1YLR412W 825 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 ADI1YMR009W 540 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 HHF2YNL030W 312 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 RPL16BYNL069C 597 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 TOA1YOR194C 861 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YNL193WYNL193W 1677 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 HBT1YDL223C 3141 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YTA7YGR270W 4140 nt2.94□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 RGL1YPL066W 1440 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PRP8YHR165C 7242 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 SPR3YGR059W 1539 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 MSR1YHR091C 1932 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 CHS2YBR038W 2892 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YGR237CYGR237C 2358 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 DNM1YLL001W 2274 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 TFC1YBR123C 1950 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 CBP2YHL038C 1893 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YDR199WYDR199W 366 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 CHZ1YER030W 462 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PRM8YGL053W 714 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PDP3YLR455W 915 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YPL142CYPL142C 318 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YBR062CYBR062C 543 nt2.93□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 ATG26YLR189C 3597 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 EXO5YBR163W 1758 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YSP2YDR326C 4317 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PEX10YDR265W 1014 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 MRM2YGL136C 963 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 RSR1YGR152C 819 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YIR020CYIR020C 303 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 CWC24YLR323C 780 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YMR141CYMR141C 309 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 RRT1YBL048W 312 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YBL065WYBL065W 345 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PHO80YOL001W 882 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PEX11YOL147C 711 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 SPC29YPL124W 762 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 MRPL40YPL173W 894 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 AIM4YBR194W 372 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 SPO71YDR104C 3738 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 LRG1YDL240W 3054 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 SCY1YGL083W 2415 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 STT4YLR305C 5703 nt2.92□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 GPI13YLL031C 3054 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 FKH2YNL068C 2589 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 HMRA1YCR097W 381 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 MET32YDR253C 576 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 VPS74YDR372C 1038 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 RPB9YGL070C 369 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PHD1YKL043W 1101 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 ECM4YKR076W 1113 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PFY1YOR122C 381 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 PIS1YPR113W 663 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 TCP1YDR212W 1680 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 VBA4YDR119W 2307 nt2.91□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 MET10YFR030W 3108 nt2.9□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 SNU56YDR240C 1479 nt2.9□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YDR537CYDR537C 606 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YGR053CYGR053C 852 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YJL007CYJL007C 315 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 VPS51YKR020W 495 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YLR252WYLR252W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YMR144WYMR144W 1029 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YOR331CYOR331C 558 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 MAL33YBR297W 1407 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 EAP1YKL204W 1899 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 PCI8YIL071C 1335 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 STP2YHR006W 1626 nt2.9□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 DSF2YBR007C 2211 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 PCK1YKR097W 1650 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YNR063WYNR063W 1824 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 UBP5YER144C 2418 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YIL175WYIL175W 318 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YJL169WYJL169W 369 nt2.89□□□□□ -1.95
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