Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KPNA1P52294 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms