Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms