Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC4P43686 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms