Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 HAA1YPR008W 2085 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 MCR1YKL150W 909 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 AIM29YKR074W 468 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 ILV5YLR355C 1188 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 COX8YLR395C 237 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 PDR17YNL264C 1053 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 NTC20YBR188C 423 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 snR54snR54 86 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 ICR1ICR1 3199 nt3.61□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 ARO80YDR421W 2853 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 PAM1YDR251W 2493 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 PFK26YIL107C 2484 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 LCB5YLR260W 2064 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YEL1YBL060W 2064 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YDL009CYDL009C 324 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 MRPL11YDL202W 750 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 EMI1YDR512C 564 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 BIG1YHR101C 1008 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YML108WYML108W 318 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YOR029WYOR029W 336 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YOR131CYOR131C 657 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YPL142CYPL142C 318 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 UBP5YER144C 2418 nt3.6□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 FRE8YLR047C 2061 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 TAF1YGR274C 3201 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 MTR4YJL050W 3222 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 PPQ1YPL179W 1650 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 AHC2YCR082W 387 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 AIM11YER093C-A 414 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 VEL1YGL258W 621 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YGR053CYGR053C 852 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YIL175WYIL175W 318 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 ANB1YJR047C 474 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 VPH2YKL119C 648 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 ARR2YPR200C 393 nt3.59□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 DBF20YPR111W 1695 nt3.59□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YGR237CYGR237C 2358 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RTR2YDR066C 591 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YDR149CYDR149C 708 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YDR269CYDR269C 324 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YLR416CYLR416C 399 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 TIF11YMR260C 462 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YBR209WYBR209W 318 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ARG2YJL071W 1725 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 HOP1YIL072W 1818 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YDL176WYDL176W 2127 nt3.58□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RNR1YER070W 2667 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 SSM4YIL030C 3960 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YER006C-AYER006C-A 318 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YGL152CYGL152C 678 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 DFG10YIL049W 762 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YLR101CYLR101C 396 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YAR047CYAR047C 321 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 CDC123YLR215C 1083 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 PSY4YBL046W 1326 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YNL296WYNL296W 315 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YOR248WYOR248W 303 nt3.57□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 USA1YML029W 2517 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 SRB4YER022W 2064 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ETP1YHL010C 1758 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 CWH43YCR017C 2862 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 MAL33YBR297W 1407 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RSF2YJR127C 4143 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YDR442WYDR442W 393 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YER079WYER079W 633 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YGR051CYGR051C 324 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RPL15AYLR029C 615 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 NOP15YNL110C 663 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YOL159CYOL159C 516 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ALG14YBR070C 714 nt3.56□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ERG5YMR015C 1617 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 CDC55YGL190C 1581 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 SSF2YDR312W 1362 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 CCM1YGR150C 2595 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RPS14AYCR031C 414 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RTT105YER104W 627 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 IRC19YLL033W 693 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ATG33YLR356W 594 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ADI1YMR009W 540 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RPS7AYOR096W 573 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 MUS81YDR386W 1899 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ATP25YMR098C 1839 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 GLC3YEL011W 2115 nt3.55□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 TOP1YOL006C 2310 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YER087C-AYER087C-A 552 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RPL1BYGL135W 654 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ERV1YGR029W 570 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YGR242WYGR242W 309 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YKL222CYKL222C 2118 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RPL1AYPL220W 654 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YPR053CYPR053C 456 nt3.54□□□□□ -1.84
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