Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms