Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNM1O00562 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms