Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NACAE9PAV3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms