Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms