Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQE9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQE9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQE9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms