Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms