Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms