Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms