Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms