Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms