Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms