Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms