Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT82Q9NSB4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms