Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms