Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms