Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CYP4F12Q9HCS2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F12Q9HCS2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms