Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPJQ9HC77 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms