Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTIF3Q9H2K0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms