Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms