Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms