Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms