Protein–RNA interactions for Protein: Q96KV7

WDR90, WD repeat-containing protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR90Q96KV7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR90Q96KV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR90Q96KV7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms