Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms