Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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