Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms