Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC112Q8NEF3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms