Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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