Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLASP1Q7Z460 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLASP1Q7Z460 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms