Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms