Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms