Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx6Q6P8X1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx6Q6P8X1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx6Q6P8X1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx6Q6P8X1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx6Q6P8X1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms