Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms