Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms