Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms