Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDUFA9Q16795 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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