Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGISQ16647 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms